AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3

Панель AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 направлена на изучение основных раковых генов, включая киназные домены и гены, участвующие в репарации ДНК. Основные характеристики:

Содержимое набора

Панель направлена на изучение 161 гена, связанного с раком.

Быстрый, оптимизированный рабочий процесс

Подготовка библиотеки для секвенирования всего за один день из всего 1 нг стартового материала высокого качества или 10 нг образца FFPE

Точные данные

Определение соматических мутаций as low as 5% variant allele frequency using local or cloud based analysis

Comprehensive Panel v3 является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотек по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.

Эта панель охватывает хотспоты, полные гены, copy number genes и меж- и внутригенные фьюжены. Эта ready-to-use панель экономит исследователям время и усилия по определению таргетов, разработке праймеров и оптимизации панелей.

Спецификации

Число ампликонов	всего 4648. 4 пула (Пул ДНК 1: 1891 ампликонов. Пул ДНК 2: 1890 ампликонов. Пул РНК 1: 447 ампликонов. Пул РНК 2: 420 ампликонов.)
Время анализа	5-6 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование)
Время ручного труда	<1,5 часа
Тип нуклеиновой кислоты	ДНК, РНК
Количество стартового материала	1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул)
Особенности содержимого	таргеты ДНК и РНК для 163 онкогенов
Multiplexing	96 dual index combinations
Механизм действия	Мультиплексная ПЦР
Для исследования каких видов подходит	Человек
Метод	Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Targeted RNA Sequencing
Класс вариаций	Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants
Для работы с какими платформами подходит	NextSeq 550, NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме)
Специальные типы образцов	кровь, FFPE
Технология	Секвенирование